Псевдогены
Заказать уникальный реферат- 4 4 страницы
- 5 + 5 источников
- Добавлена 24.04.2016
- Содержание
- Часть работы
- Список литературы
- Вопросы/Ответы
Это наблюдение указывает на то, что бактериальные псевдогены, хотя часто присутствуют в большом количестве в структуре генома, будут элиминированы относительно быстро. Эта особенность бактериальных геномов снова резко контрастирует с высшими эукариотами, у которых псевдогены часто сохраняются в течение продолжительного эволюционного периода и могут существенно совпадать у представителей отдаленных таксонов, таких как грызуны и приматы. В связи с повсеместным мутационным уклоном в сторону делеций, которые часто наблюдаются в бактериальных геномах, быстрое удаление псевдогенов может быть вызвано случайной фиксацией фоновых мутаций. Поскольку псевдогены уже давно рассматриваются как «парадигма нейтральной эволюции», эта научная гипотеза является наиболее популярной. Существует альтернативная точка зрения, в соответствии с которой псевдогены элиминируются из бактериальных геномов с помощью адаптивного процесса. Например, псевдоген может быть вредным для организма из-за увеличения энергетических затрат, связанных с транскрипцией и трансляцией нефункциональных генов и / или из-за синтеза белков, которые являются токсичными для клеток. Псевдогены, таким образом, могут некоторое время существовать в структуре геномов как эволюционная информация о белках, ферментах или метаболических путях, которые уже не являются необходимыми для дальнейшего существования вида, поскольку бактерии приспособились к новой среде обитания. Кроме того, было высказано предположение, что уменьшение угрозы существованию бактерий в защищенной внутриклеточной среде понижает скорость геномных делеций, что делает устранение псевдогенов более медленным процессом. Тем не менее, эта научная концепция была основана на предположении, что горизонтальные переносы генов редки в популяциях внутриклеточных бактерий.
Список использованной литературы:
Tutar Y. Pseudogenes//Functional Genomics.- 2012.-V.12.- P. 4-8.
Pink R. C., Wicks K., Caley D. P., Punch E. K., Jacobs L., Carter D. R.F. Pseudogenes: pseudo-functional or key regulators in health and disease //RNA.-2011.- vol. 17.-№ 5.- P. 792–798.
Chang Mian J.I., You H.A., Ling L.W., Hua P.G., Ce W.G.. Identification and bioinformatics analysis of pseudogenes from whole genome sequence of Phaeodactylum tricornutum//Chin. Sci. Bull.- 2013.- V. 58.- P. 1010-1018.
Fuxelius H.H., Darby A.C., Cho N.H., Andersson G.E. Visualization of pseudogenes in intracellular bacteria reveals the different tracks to gene destruction// Genome Biology.- 2008.- V. 9.- P. 42-57.
Lawrence J.G., Hendrix R.W., Casjens S. Where are the pseudogenes in bacterial genomes? //Trends Microbiol.- 2001.- V. 9.- P. 535-540.
Список использованной литературы:
1) Tutar Y. Pseudogenes//Functional Genomics.- 2012.-V.12.- P. 4-8.
2) Pink R. C., Wicks K., Caley D. P., Punch E. K., Jacobs L., Carter D. R.F. Pseudogenes: pseudo-functional or key regulators in health and disease //RNA.-2011.- vol. 17.-№ 5.- P. 792–798.
3) Chang Mian J.I., You H.A., Ling L.W., Hua P.G., Ce W.G.. Identification and bioinformatics analysis of pseudogenes from whole genome sequence of Phaeodactylum tricornutum//Chin. Sci. Bull.- 2013.- V. 58.- P. 1010-1018.
4) Fuxelius H.H., Darby A.C., Cho N.H., Andersson G.E. Visualization of pseudogenes in intracellular bacteria reveals the different tracks to gene destruction// Genome Biology.- 2008.- V. 9.- P. 42-57.
5) Lawrence J.G., Hendrix R.W., Casjens S. Where are the pseudogenes in bacterial genomes? //Trends Microbiol.- 2001.- V. 9.- P. 535-540.
Вопрос-ответ:
Почему бактериальные псевдогены быстро элиминируются из структуры генома?
Бактериальные псевдогены быстро элиминируются из генома из-за особенностей бактериальных геномов. В отличие от высших эукариот, у которых псевдогены могут сохраняться в течение продолжительного эволюционного периода, бактериальные псевдогены не сохраняются так долго. Это может быть связано с повсеместным мутационным уклоном и быстрым исчезновением нефункциональных участков ДНК.
В чем отличие между псевдогенами в бактериях и высших эукариот?
Отличие между псевдогенами в бактериях и высших эукариот заключается в их сохранении в геноме. В бактериях псевдогены элиминируются относительно быстро из структуры генома, в то время как у высших эукариот псевдогены могут сохраняться в течение продолжительного эволюционного периода и могут совпадать у представителей отдаленных таксонов. Это указывает на различия в механизмах поддержания и эволюции геномов у бактерий и эукариот.
Почему псевдогены у бактерий удаляются из генома, а у высших эукариот сохраняются?
Разница между удалением псевдогенов из генома у бактерий и сохранением их у высших эукариот может объясняться различиями в мутационных процессах и механизмах поддержания генома. Возможно, бактерии испытывают большее давление на быстрое избавление от нефункциональных участков ДНК, в то время как высшим эукариотам это не так важно. Также, механизмы контроля и поддержания генома могут быть разными у бактерий и эукариот, что приводит к сохранению псевдогенов у последних.
Есть ли сходство между псевдогенами у грызунов и приматов?
Да, есть сходство между псевдогенами у грызунов и приматов. Несмотря на то, что они принадлежат к отдаленным таксоном, псевдогены у них могут существенно совпадать. Это указывает на то, что несмотря на отдаленную эволюционную связь, гены-предки псевдогенов могли быть общими для этих групп животных. Это может свидетельствовать о наличии общих функциональных элементов в геноме у грызунов и приматов.
Для чего псевдогены нужны в бактериальных геномах?
Псевдогены в бактериальных геномах играют незначительную роль и в большинстве случаев являются нефункциональными участками ДНК.
Как долго псевдогены сохраняются в геномах высших эукариот?
В отличие от бактериальных геномов, псевдогены в геномах высших эукариот могут сохраняться в течение продолжительного эволюционного периода.
Чем отличаются псевдогены в бактериях и высших эукариотах?
Отличие заключается в быстроте элиминации псевдогенов в бактериальных геномах и их сохранении в геномах высших эукариот.
Почему псевдогены в бактериальных геномах элиминируются относительно быстро?
Бактериальные псевдогены элиминируются относительно быстро из-за повсеместного мутационного уклона в бактериальных геномах.
Совпадают ли псевдогены у представителей отдаленных таксонов, таких как грызуны и приматы?
Да, псевдогены могут существенно совпадать у представителей отдаленных таксонов, таких как грызуны и приматы.